Nhưng vụ việc bức xúc nhất xảy ra ở vòng 3 khi CLB Hà Nội của bầu Kiên tiếp K.Khánh Hòa. Trận này, trọng tài chính Bùi Quang Thông bị đội khách tố cáo “có lý lịch không trong sạch” - ông Thông thời còn là cầu thủ có dính đến một đường dây bán độ và đã phải nhận một án kỷ luật rất nặng từ VFF. Trưởng Ban Trọng tài VFF, ông Dương Vũ Lâm, thừa nhận: “Đúng là trọng tài Bùi Quang Thông từng bị kỷ luật vì hành vi móc ngoặc khi còn là cầu thủ. Tuy nhiên, đó là một án phạt tập thể chứ không phải của riêng cá nhân trọng tài Thông”. Dù vậy, Ban Trọng tài VFF vẫn quyết định đình chỉ công tác của trọng tài Thông. Tuy nhiên, ông Thông lại cầm còi trong trận thắng của CLB Hà Nội, một trong 2 trận thắng ở mùa này của đội bóng do Phó Chủ tịch VPF Nguyễn Đức Kiên làm chủ.
Dù bị xử ép trên sân Lạch Tray nhưng CLB SLNA khẳng định sẽ không khiếu nại vì như giải thích của HLV Nguyễn Hữu Thắng: “Trọng tài bây giờ là câu chuyện nhạy cảm, nếu chúng tôi chỉ trích có khi chính chúng tôi lại gặp rắc rối”. Nhiều đội bóng vẫn cảm thấy ngán ngẩm với công tác trọng tài nhưng họ đã tự kiềm chế. Kể từ khi VPF quản lý các giải bóng đá chuyên nghiệp, thu nhập của trọng tài đã tăng nhiều lần nhưng không vì thế mà những bức xúc quanh chuyện trọng tài giảm bớt.
Trưởng Ban Trọng tài Dương Vũ Lâm thừa nhận: “Trình độ trọng tài Việt Nam không thể nâng lên trong một sớm một chiều dù chúng tôi đã cố gắng nâng cao trình độ cho họ bằng cách mở các lớp tập huấn với các giảng viên FIFA cấp cao đào tạo”. Theo ông Lâm, ít nhất cũng phải 4, 5 năm nữa, Việt Nam mới có thế hệ trọng tài được đào tạo bài bản. Việc xúc tiến khẩn trương thành lập ban đạo đức cũng là cách để VPF có thể giám sát hoạt động của các trọng tài trong nước. Tuy nhiên, cũng có những ý kiến lo ngại rồi đây khi có ban đạo đức thì những vi phạm của trọng tài sẽ được xử lý nội bộ và rất có thể những vụ việc bức xúc như của trọng tài Bùi Quang Thông sẽ lại nhanh chóng bị lãng quên...
